ARN Mensajero: ¿Qué Es? Determinación De La Calidad, ARN Intermediario, Clasificación y Análisis Confiable

arn mensajero a proteina

Es el ácido ribonucleico el cual transfiere el código genético que procede del ADN del núcleo celular a un ribosoma en el citoplasmaero.

¿Qué es el ARN?

El registro de investigación de ARN es bastante corto. No fue sino hasta la primera mitad del siglo XX que el ARN fue identificado como una macromolécula biológica independiente del ADN por los químicos emprendedores de los carbohidratos.

Desde que se hizo esta distinción, se han encontrado múltiples clases de ARN, que incluyen: ARN mensajero (ARNm), ARN ribosómico (ARNr), ARN pequeño, ARN micro y ARN largo no codificante.

De manera similar al ADN, el ARN presenta un conjunto único de desafíos para los investigadores, incluida la susceptibilidad a las RNasas, la degradación y la cizalla omnipresentes por pipeteo.

El primo molecular del ADN, el ARN juega innumerables papeles importantes en la biología molecular, que incluyen: servir como genoma, actividad enzimática y participar en cada paso de la expresión génica.

Debido a la ubicuidad del ARN en la biología, los científicos han invertido tiempo y esfuerzo en comprender sus propiedades químicas y biológicas.

En un esfuerzo por comprender la biología del ARN, los investigadores han desarrollado una multitud de técnicas de biología molecular relevantes, que van desde la PCR de transcripción inversa y la electroforesis en gel de agarosa, hasta los micro cadenas y la secuenciación de próxima generación.

Con el objetivo de modernizar y simplificar el análisis de ARN y los flujos de trabajo de control de calidad, produce varias soluciones para flujos de trabajo de ARN.

El ARN es importante para numerosas aplicaciones de biología molecular, que incluyen: qPCR, NGS y micro cadenas. Una comprensión profunda de la biología del ARN afecta una amplia gama de investigación biológica, desde la agricultura y la medicina hasta la evolución y la edición del genoma.

Ubicuo en biología, el ARN es crucial para procesos diversos y significativos en biología molecular. Como tal, es una macromolécula biológica de interés para científicos de diversos orígenes e intereses.

Fundamentales para la comprensión de todo, desde el origen de la vida hasta la biología del cáncer, se han desarrollado numerosas aplicaciones para comprender mejor las funciones biológicas del ARN.

Las sofisticadas aplicaciones posteriores, especialmente NGS, requieren el uso de ARN de una calidad adecuada para garantizar resultados confiables.

Sin embargo, los métodos tradicionales de análisis de ARN carecen del rendimiento, la sensibilidad y la precisión necesarios para evaluar con confianza la idoneidad del ARN para aplicaciones posteriores.

Por ejemplo, la electroforesis en gel de agarosa de ARN es una solución de bajo rendimiento que, además de carecer de capacidades adecuadas de resolución y cuantificación, es tediosa y lleva mucho tiempo.

ARN total y determinación de la calidad

La determinación de la calidad del ARN total es de importancia absoluta para el análisis de micro cadenas, NGS y otras aplicaciones sensibles a la degradación y contaminación por ARN.

Los métodos heredados de análisis de ARN exigen altas concentraciones de entrada con capacidades limitadas de resolución y cuantificación. Y proporcionan una cuantificación, calificación y tamaño superiores de las muestras de ARN total.

Para ayudar en la evaluación empírica de la calidad total del ARN, AATI desarrolló el Número de calidad del ARN (RQN) para el software de análisis de datos .

Calculado automáticamente por PROSize para cada muestra de ARN total, RQN tiene en cuenta varios factores, incluida la relación entre los picos ribosómicos, la pequeña región de ARN y la resolución entre los picos. Informados en una escala de 1 a 10, los valores más altos indican una muestra de ARN total de mayor calidad.

El kit de análisis de ARN de sensibilidad estándar DNF-471 y el kit de análisis de ARN de alta sensibilidad DNF-472.

Las resoluciones de separación de estos kits brindan a los investigadores una visión clara de los diversos perfiles de separación del ARN total (Descargar la Nota de aplicación: «Detección de la degradación del ARN de la planta con el analizador de fragmentos»).

ARN mensajero (intermediario)

El ARN mensajero (ARNm), el intermediario entre el ADN y la proteína, es de interés para los investigadores, ya que proporciona información sobre la actividad de los genes.

La secuenciación a gran escala del ARNm de un organismo, denominado transcriptómica, permite a los investigadores determinar qué genes y regiones genómicas son activas bajo diferentes condiciones.

Al igual que con otras aplicaciones de NGS, el análisis de CC apropiado de ácidos nucleicos crudos garantiza que solo se secuencian las muestras adecuadas.

ARN Pequeño (clasificación)

El ARN pequeño es una clasificación amplia y creciente, que incluye: microRNA, siRNA, piRNA y snRNA. El análisis de ARN pequeños a menudo es difícil, ya que muchos métodos de análisis carecen de la resolución y la sensibilidad mínimas requeridas para una separación, dimensionamiento y cuantificación precisas.

El kit de análisis de ARN pequeño DNF-470 para el analizador de fragmentos y el analizador de fragmentos INFINITY brinda sensibilidad suprema, rendimiento variable y resolución notable para el análisis de CC de ARN de pequeño tamaño.

FFPE ARN y análisis confiable

El análisis de CC confiable del ARN de FFPE es esencial para obtener resultados confidenciales de NGS.

Las muestras de ARN FFPE exhiben niveles más altos de degradación y reticulación, lo que limita la aplicación del RQN a estas muestras.

La métrica de calidad DV200 para PROSize fue desarrollada por científicos de Ilumina para abordar los desafíos únicos de control de calidad del ARN FFPE.

El DV200 proporciona a los investigadores una herramienta poderosa para analizar confiablemente muestras de ARN FFPE adecuadas para NGS a partir de muestras inadecuadas, ahorrando tiempo y costos.